2000年学校撤消总务处，成立后勤管理处，作为甲方代表学校行使行政管理职能；成立后勤集团，作为乙方实行企业化管理。

2004年启动后勤改革工作，实行“小机关多实体”管理模式，撤销后勤管理处、后勤集团，成立后勤工作委员会，统一协调、规范、管理学校后勤各项工作；下设办公室代表后勤工作委员会与后勤实体签订甲乙方服务合同。

2008年根据我校后勤管理与服务工作需要，对人事分配、财务、资产制度进行改革，并将原有实体重新整合。

2018年底开展进一步深化后勤管理改革工作。继续实行“小机关多实体”管理模式，后勤工作委员会办公室更名为后勤保障处，不再实行校内甲乙方管理模式，以目标责任制为抓手，后勤保障处直接管理各中心，后勤保障处与各中心签订《工作任务书》。当前，内设综合科、质量监督科、工程技术科、人力资源科及结算科5个科室，设饮食服务中心、昌平校区物业管理服务中心、学院路校区物业管理服务中心、国际交流中心、幼儿园共5个实体。